现代化的企业发展越来越重视内部制度审计，完善的制度审计能够促进企业目标的实现，经营效率的提升和风险防御能力的增强。制度审计如何操作呢？无非就是合理制定规章制度，设定管理流程，加强制度执行的监督。
一、制定合理的制度
企业管理中首先应根据自身发展的需要，制定有效的规章制度。只有制定规范的规章制度，才能为制度审计提供基础。制度就是一根管理高压线，让大家在工作中有章可循，有标准可依，只有按制度做事，才能使企业管理变得规范。
制度制定是否合理，对工作目标的实现有直接影响。英国人发现澳洲大陆以后，开始大量地移民。初期制定的政策是按照客轮出发时所载人数结算费用，可这种方式带来的问题是能够抵达澳洲的人数大量减少。英国人分析原因后发现，客轮老板在运输过程中根本不关心客轮人员的死活，导致大量人员在运输过程中出现伤亡情况。找到原因后，英国人改变结算政策，改为以到达澳洲的人数进行结算，安全抵达人数大幅增长。通过这个实例，我们可以看出，要想完成企业设定的目标，制度就必须要合理制定。
二、依据制度，设定管理流程
有了制度，再走流程，让部门职责分明，员工各司其职，保证制度能够落地。举个简单的例子，企业新员工入职，都有新员工入职流程，第一步干啥，第二步干啥等等。试想一下，如果没有这个入职流程，不管是人力资源，还是新员工都会感觉工作无法着手。这也就是为什么麦当劳的员工从入职到独立上岗仅仅只需要6个小时，流程的设定极大地提升了工作效率。即使员工出现流动，只要按照流程，新员工也能够很快上手新工作。由此可见，设定流程的意义极大。
流程的设定需要充分考虑到不相容岗位分离、授权审批、部门职责分工等因素，确保流程设定的合理性、完整性和规范性。
三、监督制度、流程的执行
管理制度设计得再合理、流程设计得再完美，如果没有真正的执行，那也相当于把制度锁进了档案柜，毫无意义。因此，制度审计的目的就是，监督制度的执行力和流程执行的合规性。
那么，制度审计到底如何操作呢？
1、把制度文字和流程表格化，指标化，对制度进行细化分解，摘取可以量化考核的指标设计检查表，注明管理风险关键点。
2、制定项目制度审计计划，编制审计项目实施方案。
3、抽调专人成立审计小组，依据审计计划和实施方案开展审计，审计过程中着重关注风险关键点的工作执行情况。
4、审计过程中，审计人员及时编制审计工作底稿，收集审计证据。
5、审计小组出具审计报告，提出审计发现的问题和审计意见，并提出合理化建议。
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